В Катунском заповеднике были установлены и успешно применены фотоловушки. Фотоловушки являются одним из наиболее современных и эффективных способов наблюдения за животными в естественной среде обитания. Фотоловушки работают в круглосуточном режиме и реагируют на движение и тепло. Данный вид наблюдения позволяет вести мониторинг видового состава фауны, следить за перемещениями крупных видов млекопитающих, а также определить половой и возрастной структуры популяции. Наиболее часто регистрируемыми при помощи фотоловушек видами в заповеднике стали косуля, марал, лось и медведь.